آیت الله سبحانی از مراجع تقلید در دیدار نماینده ولی فقیه در امور حج و زیارت گفت: امسال از زمانی که در جریان موضوع حج قرار گرفتم، با تعطیلی حج مخالف بودم و معتقد بودم که نباید این فریضه الهی تحت تأثیر مسائل سیاسی قرار گیرد.
مرجع تقلید شیعیان گفت: ملاک اصلی در ارزیابی هرگونه گفتگو و مذاکرات حفظ استقلال کشور، صیانت از اصول و ارزشهای ملی و تأمین منافع ملت است.
آیتالله جعفر سبحانی از مراجع تقلید در پیامی ضمن تبریک انتخاب آیتالله سیدمجتبی خامنهای به عنوان سومین رهبر انقلاب اسلامی برای ایشان طلب موفقیت کرد.
آیتالله جعفر سبحانی از مراجع تقلید در پاسخ به یک استفتاء تاکید کرد: صرفِ موتورسـواری، فینفسه دلیل شرعی بر حرمت ندارد و ملاک اصلی، رعایت موازین شرعی و اخلاقی در نحوه انجام آن است.
مرجع تقلید شیعیان به مباحث طرح شده در مناظره اخیر پیرامون اهل بیت علیهم السلام و چگونگی شهادت حضرت فاطمه زهرا سلام الله علیها پاسخ داد.
آیت الله سبحانی از مراجع تقلید در پیامی با اشاره به نامه خود به قوه قضایه به منظور حل ریشه ای مسئله عدم تمکن مردان در پرداخت مهریه زنان با مشروط کردن توان زوج در پرداخت مهریه زوجه، توضیحات و مبنای فقهی آن را اعلام نمود.
آیتالله جعفر سبحانی از مراجع تقلید در نامهای به رییس دستگاه قضا با انتقاد از وضعیت فعلی قانون مهریه تأکید کرد: مهریه باید مبتنی بر استطاعت واقعی مرد باشد، زیرا شرط پرداخت مازاد بر توان، از نظر شرعی الزامآور نیست.
آیتالله جعفر سبحانی با تاکید بر پیگیری مجدانه دروس حوزوی گفت: انشاءالله تعطیلات را کاهش دهیدو یکی از مشکلات حوزه، تعطیلات بسیار است.
مرجع تقلید شیعیان گفت: مدارس علمیه باید مسکن طلاب باشند و طلاب درس و بحث را در فضای آزاد حوزه دنبال کنند.
آیتالله جعفر سبحانی گفت: عاشورا آغاز یک حرکت تاریخی برای نجات بشر از ظلم و تباهی بود و اربعین، استمرار همان مسیر است که با فداکاری اسیران دشت کربلا، پیام این قیام به گوش جهانیان رسید.